GTx-RNA

GTx-RNA da DNA GTx Bioinformatics é um serviço especializado que utiliza ferramentas avançadas de bioinformática e metodologias para analisar dados de sequenciamento de RNA (RNA-Seq). Este serviço oferece soluções abrangentes para instituições de pesquisa e empresas interessadas em compreender a expressão gênica, o processo de splicing alternativo e os perfis transcriptômicos em diferentes amostras biológicas e condições.

SOLUTIONS

Software tools, panels, exclusive pipelines and more, everything you need for mining and interpreting biological data. Accurate, complete, and sophisticated bioinformatics services to drive your tests, discovery and maximize your ROI.

Precision Medicine

In the realm of healthcare, Precision Medicine emerges as a revolutionary approach that tailors medical treatments to individual patients based on their unique genetic makeup. By harnessing cutting-edge technologies and comprehensive data analysis, Precision Medicine ushers in a new era of personalized healthcare, offering the potential to improve patient outcomes, enhance disease prevention, and optimize therapeutic strategies.

As Precision Medicine continues to advance, its impact on healthcare is poised to be transformative. By harnessing the power of personalized data-driven insights, this groundbreaking approach has the potential to reshape the medical landscape, leading to an era of more precise, effective, and patient-centric healthcare that holds the promise of improved outcomes and enhanced well-being for individuals worldwide.

GTx Onco™

GTx-Onco is a computational tool for the interpretation of cancer genome data (large gene panels, WES and/or WGS). GTx-Onco provides actionable recommendations, linked to therapeutic and nutritional aspects, based on the genetic profile of the tumor.

GTx - 500

GTx-500 is a NGS-based assay that enable a genomic profiling of the tumor by sequencing a panel of >500 cancer genes. Furthermore, the assay allows the calculation of two important immunological parameters: MSI (microsatellite instability) and TMB (tumor mutational burden).

Environmental & Agricultural

Omics technologies and agriculture converge to unlock a new era of sustainable and efficient farming practices. By harnessing the power of genetic information, farmers and researchers are redefining the way we cultivate crops and raise livestock. With DNA GTx Bioinformatics solutions as their ally, farmers are poised to cultivate a resilient and prosperous agricultural landscape, meeting the demands of a rapidly evolving world.

At the same pace, omics technologies are revolutionizing our approach to environmental conservation, ecological restoration, and sustainable resource management. DNA GTx Bioinformatics solutions in genomics, metagenomics and meta-barcoding empower scientists and companies to uncover crucial insights into the intricate workings of ecosystems. DNA GTx Bioinformatics is poised to forge a harmonious relationship between humanity and the natural world, ensuring a thriving and resilient planet for future generations.

GTx Proteo™

GTx Proteo is a computational tool for proteogenomics. Our know-how in the analysis of MS/MS data allowed us to develop a platform for the integration of proteomic, transcriptomic and genomic data.

GTx - Meta

GTx-Meta is a pipeline for the analysis of metagenomics data, both 16S/18S or shotgun libraries. It takes FASTQ files as input and generates BAM files as products. Furthermore, GTx-Meta produces a detailed report with several downstream analyses, adapted to either a taxonomic or functional approach.
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GTx - Barcode

Metabarcoding is the large-scale taxonomic identification of complex environmental samples through the sequencing of one or few genes (usually present in the mitochondrial genome). GTx-Barcode is a pipeline for the analysis of metabarcoding data.

GTx - Pipeline

DNA GTx Pipeline is a pipeline framework and process manager that allows an optimization of the computations demands in a given project with a reduction in costs and time. Some functionalities include: parallelization, automatic check of process status and an interface for the management of processes.

Next Generation Sequencing (NGS) Analysis

Our team includes pioneers in NGS analysis. We offer processing and analysis services for various technologies, including variant calling and visualization (D-KRYPT), RNA-Seq (DNA GTx RNA), metagenomics and others (consult us).

GTx - RNA

GTx-Onco is a computational tool for the interpretation of cancer genome data (large gene panels, WES and/or WGS). GTx-Onco provides actionable recommendations, linked to therapeutic and nutritional aspects, based on the genetic profile of the tumor.
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Genome Assembly

DNA-GTx Bioinformatics "Genome Assembly and Annotation Service" is a cutting-edge bioinformatics service designed to assist researchers, geneticists, and biologists in analyzing and understanding the complex structure and function of genomes. This service combines advanced computational algorithms and expertise to assemble and annotate genomes, providing valuable insights into genetic composition, gene identification, regulatory elements, and other functional elements.
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GTx-Population

Unlock the secrets of human diversity and evolutionary history with GTx-Population, the cutting-edge bioinformatics service tailored for populational genomics. Delve deep into the genetic tapestry of populations and unearth invaluable insights into their unique genetic makeup, disease associations, migratory patterns, and ancestral origins.

APLICAÇÕES

Análise da expressão gênica em diversos organismos e tecidos.

Identificação de biomarcadores para doenças ou resposta a medicamentos.

Estudo de splicing alternativo e regulação de isoformas.

Investigação de redes e vias de regulação gênica.

Transcriptômica comparativa e estudos evolutivos.

PRINCIPAIS CARACTERÍSTICAS

Controle de Qualidade dos Dados: O serviço começa com uma análise robusta de controle de qualidade dos dados brutos de RNA-Seq para garantir uma análise precisa e confiável posteriormente. Isso inclui avaliar a qualidade do sequenciamento, a avaliação do alinhamento das leituras e a identificação de possíveis vieses ou artefatos introduzidos durante a preparação das bibliotecas ou o sequenciamento.

Alinhamento e Mapeamento de Reads: O GTx-RNA utiliza algoritmos de alinhamento de última geração para mapear os reads de sequenciamento em um genoma de referência ou transcriptoma. Esse processo permite que os pesquisadores determinem a origem e a localização de cada read dentro do genoma e facilite análises subsequentes.

Análise da Expressão Gênica: O serviço quantifica os níveis de expressão gênica estimando a abundância de transcritos a partir das leituras alinhadas. Ele fornece valores de expressão brutos e normalizados, permitindo que os pesquisadores comparem perfis de expressão entre amostras, identifiquem genes diferencialmente expressos e realizem análises estatísticas.

Reconstrução do Transcriptoma: Além da análise ao nível de genes, o GTx-RNA reconstrói e quantifica o transcriptoma completo identificando e caracterizando eventos de splicing alternativo, transcritos novos e RNAs não codificadores. Isso permite que os pesquisadores obtenham uma compreensão abrangente da paisagem transcriptômica e dos mecanismos de regulação.

Análise de Expressão Diferencial: Oferecemos análise de expressão diferencial para identificar genes ou transcritos que apresentam mudanças significativas de expressão entre diferentes condições de amostra ou grupos experimentais. Essa análise ajuda a descobrir genes associados a processos biológicos específicos, doenças ou tratamentos.

Anotação Funcional: Diversos bancos de dados e ferramentas biológicas são integrados para fornecer anotação funcional dos genes diferencialmente expressos. Isso ajuda os pesquisadores a interpretar a relevância biológica de seus achados, identificando termos enriquecidos de ontologia gênica, vias biológicas e domínios proteicos associados.

Visualização e Exploração de Dados: O GTx-RNA oferece visualizações interativas e ferramentas de exploração de dados para facilitar a exploração detalhada dos dados de RNA-Seq. Os pesquisadores podem visualizar padrões de expressão, gerar heatmaps, gráficos de dispersão e gráficos de vulcão, e extrair informações adicionais dos dados.

Análise de Splicing Alternativo: O serviço inclui algoritmos e ferramentas especializadas para analisar eventos de splicing alternativo. Ele identifica diferentes padrões de splicing e quantifica a abundância relativa de isoformas originadas por splicing alternativo, permitindo que os pesquisadores estudem os mecanismos regulatórios e as implicações funcionais do splicing alternativo.

Detecção de eventos de fusão: O GTx-RNA identifica eventos de fusão envolvendo diferentes RNAs e fornece anotação completa desses eventos.

Integração com Análises Subsequentes: Nosso serviço garante compatibilidade com diversas análises subsequentes, como análise de enriquecimento de conjuntos de genes, análise de redes e análise de vias. Essa integração permite que os pesquisadores obtenham uma compreensão mais profunda dos processos biológicos e das redes de regulação subjacentes aos seus dados de RNA-Seq.

Segurança e Confidencialidade dos Dados: Priorizamos a privacidade e segurança dos dados. Garantimos a conformidade com regulamentações de privacidade e implementamos medidas robustas de proteção de dados para salvaguardar a confidencialidade dos dados de RNA-Seq fornecidos pelos pesquisadores.

BENEFÍCIOS

Análise abrangente de dados de RNA-Seq para desvendar padrões de expressão gênica, eventos de splicing alternativo e perfis transcriptômicos.

Identificação de genes diferencialmente expressos e anotação funcional para entender processos biológicos e vias envolvidas.

Pipelines de análise personalizáveis adaptados a perguntas específicas e desenhos experimentais.

Acesso a ferramentas e algoritmos avançados de bioinformática para resultados precisos e confiáveis.

Suporte especializado e orientação por profissionais de bioinformática para interpretar descobertas e solucionar problemas.

Customized

DNA GTx Bioinformatics recognizes that each customer is unique, with distinct preferences, requirements, and aspirations. Gone are the days of one-size-fits-all approaches. Instead, businesses are leveraging advanced technologies, data analytics, and personalized insights to understand customers on a granular level. By offering tailored experiences, products, and solutions, DNA GTx Bioinformatics hopes to empower consumers and foster a deeper sense of satisfaction and loyalty. So, if you have a bioinformatics problem that needs to be addressed through innovative solutions, DNA GTx Bioinformatics can help you.

The amount of genomic data generated represents the revolution in biological and medical sciences established by new DNA sequencing technologies. In order to encompass the data complexity and the desirable access and analysis flexibility we have a PhD-level team to design and implement the solutions you need to improve your services and products capabilities by helping your clients and patients more satisfied.Our bioinformatics customization services are conducted in close contact and interaction with your team, focused on cost reduction, quality and quick responses.

  • To adopt a new and customized interface to monitor your data analysis pipeline;
  • To improve processes by making them faster, integrated, automated, and stable;
  • Achieve a superior level in Quality Control by adding and automatizing new checking points;
  • Add value to final analysis and reports by employing different methods and meeting new market demands;
  • Monitor the sample processing by tracking the whole flux with secure and updated interface, hosted in the cloud or on-premises.